黑暗榮耀第二季完結大陸講述的是 ：小五郎等人代替感冒的阿笠博士到伊豆參加推理之旅 。活動規定 ，如果能夠找出推理之旅的主辦人就可以免費住宿並可獲得一個包含某種病毒程序的磁盤 。但是在旅途中不知什麽人扮成暗夜公爵把柯南從欄杆上推了下去 ！之後柯南打電話詢問阿笠博士關於程序的事情得知了病毒的事情 。晚餐後回房間時柯南和小蘭偶遇和明子發生口角的前田並被前田邀請卻觀看夜景 。就在這時暗夜公爵卻墜樓生亡 ！